Piwikが入ってるディレクトリ全体にBasic認証をかけたら、トラッキングが上手くいかない。
と思ったら、Matomoユーザー会のページに書いてあった。
例えば、すべてのファイルへのアクセスを、あなたの IP のみに制限したり、piwik.php と piwik.js（この 2 ファイルのみトラッキングに必要です。) への外部アクセスのみ許可することができます。
セキュリティのための Matomo(Piwik) 設定方法 | Matomoユーザー会
なのでhtaccessに以下を追加
<Files ~ "^piwik\.(js|php)|robots\.txt$"> Allow from all Satisfy any </Files>
これで、Basic認証をかけていてもpiwik.js/piwik.php/robots.txtにアクセスすることが出来る様になる。
